研究人員可以使用 Navinci 的基于鄰近連接的創(chuàng)新空間蛋白質(zhì)組學(xué)解決方案組合來可視化和量化蛋白質(zhì)、它們的相互作用以及細胞和組織中的修飾。

蛋白質(zhì)形成巨大、復(fù)雜的相互作用網(wǎng)絡(luò)來介導(dǎo)細胞功能。它們的表達和結(jié)合是動態(tài)的，細胞響應(yīng)內(nèi)部和外部刺激而上調(diào)或下調(diào)蛋白質(zhì)水平以及蛋白質(zhì)復(fù)合物的組裝和分解。蛋白質(zhì)功能可以通過翻譯后修飾 (PTM)、組織分布模式和亞細胞定位進一步完善。

蛋白質(zhì)并不是孤立發(fā)揮作用的。大多數(shù)蛋白質(zhì)功能是由蛋白質(zhì)-蛋白質(zhì)相互作用 (PPI) 和 PTM 介導(dǎo)的。蛋白質(zhì)相互作用組的一個節(jié)點的破壞可能會破壞整個網(wǎng)絡(luò)的平衡。因此，闡明 PPI 是了解健康和疾病中的細胞信號傳導(dǎo)途徑以及識別新藥物靶點的關(guān)鍵。  

為了充分了解蛋白質(zhì)功能的復(fù)雜性，有必要在其天然環(huán)境中觀察 PPI，然而，該領(lǐng)域的檢測工具歷來受到限制。使用免疫共沉淀、蛋白質(zhì)印跡或 FRET/BRET 測定等技術(shù)無法獲得蛋白質(zhì)動態(tài)的空間視圖，這些技術(shù)會破壞細胞和組織結(jié)構(gòu)或天然蛋白質(zhì)狀態(tài)。此外，使用傳統(tǒng)的免疫熒光 (IF) 和免疫組織化學(xué) (IHC) 方法無法可靠地進行 PPI 研究，這些方法只能確定兩個熒光標簽是否出現(xiàn)共定位，這可能是分辨率限制的結(jié)果，而不是真正的結(jié)果。相互作用。

Naveni ®基于鄰近連接的檢測是下一代技術(shù)，可 通過檢測和可視化改進蛋白質(zhì)及其修飾的原位研究：

• 蛋白質(zhì)-蛋白質(zhì)相互作用
  

• 同時游離和相互作用的蛋白質(zhì)
  

• 翻譯后修飾（例如磷酸化）

• 蛋白質(zhì)定位和分布

建立在遺產(chǎn)之上

開發(fā)原始鄰近連接分析 (PLA) 的先驅(qū)者也構(gòu)建了 Navinci 的平臺。Navinci 的產(chǎn)品基于 Naveni ®鄰近連接技術(shù)，這是一種基于鄰近連接的方法，利用寡核苷酸設(shè)計和抗體-寡核苷酸綴合物的現(xiàn)代進步，在特異性、靈敏度、易用性和穩(wěn)定性方面比現(xiàn)有空間蛋白質(zhì)組學(xué)技術(shù)具有顯著優(yōu)勢。數(shù)據(jù)解釋。

優(yōu)異的特異性

Naveni ®鄰近連接技術(shù)使用一對精心挑選的 Navenibodies（與專有寡核苷酸臂綴合的抗體）來直接（即通過初級綴合物系統(tǒng)）或間接（即通過次級綴合物系統(tǒng)）檢測感興趣的靶標。僅當(dāng)檢測到的蛋白質(zhì)距離為 40 nm 或更小時，Navanibody 對之間才會發(fā)生鄰近連接，從而確保 PPI 檢測。通過 Navenibody 對對靶標進行雙重識別，通過減少抗體交叉反應(yīng)性引起的非特異性結(jié)合來增強特異性。

高靈敏度

專有的 UnFold 檢測系統(tǒng)可放大信號，與現(xiàn)有選項相比，可以實現(xiàn)高靈敏度和更高的信噪比。當(dāng)發(fā)生鄰近連接時，Navenibodies 上的寡核苷酸探針被激活并雜交以形成 DNA 環(huán)。添加聚合酶后，就會啟動滾環(huán)擴增 (RCA) 反應(yīng)，從而擴增環(huán)序列。這增強了信號強度，因為每個重復(fù)序列都可以通過單獨的熒光團標記的檢測寡核苷酸進行檢測，從而導(dǎo)致數(shù)百個熒光標簽標記單個 PPI。

清晰的目標檢測和定量

這些信號可以作為不同的熒光或顯色點進行檢測，可以通過熒光或明場顯微鏡（取決于所選的試劑盒格式）進行可視化。使用數(shù)字圖像分析或視覺解釋可以輕松量化結(jié)果。

無需人工表達

由于 Naveni ®鄰近連接技術(shù)，研究人員有望實現(xiàn)比傳統(tǒng) PLA 高達 10 倍的靈敏度提高，從而可以檢測內(nèi)源水平的低豐度蛋白質(zhì)或難以檢測的靶標，而無需實驗過度表達，并且只需極少的投入使用珍貴（且昂貴）的抗體。

與現(xiàn)有的組織學(xué)工作流程和設(shè)備兼容

所有 Navinci 產(chǎn)品均與現(xiàn)有的組織學(xué)工作流程和標準組織學(xué)設(shè)備兼容。可選擇明場顯微鏡和熒光顯微鏡，無需額外儀器。協(xié)議與核染料或組織學(xué)染色劑（如蘇木精和伊紅等）共染色兼容，可在保留的細胞或組織結(jié)構(gòu)內(nèi)提供目標 PPI 的可視化。